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Unidad de Secuenciación Sanger y NGS

La Unidad de Secuenciación Sanger y NGS ofrece servicios de apoyo a la investigación para académicos y estudiantes. Provee acceso a equipamiento especializado y cuenta con personal capacitado que brinda asesorías técnicas, apoyo en la implementación de protocolos, procesamiento de muestras y generación de datos. Formamos parte de una plataforma de apoyo que busca compartir el uso de instrumentos científicos y el conocimiento técnico experto para promover la ciencia y la formación en las áreas disciplinarias correspondientes.

Gracias a nuestras tecnologías, es posible analizar un gran número de moléculas y generar una enorme cantidad de información en poco tiempo. Si el servicio que usted necesita no se encuentra descrito en esta sección, por favor contáctenos. Aquí solo se publican los servicios más solicitados.


Servicios y Equipos


Equipos

Secuenciación capilar

ABI 3500XL

Contamos con un analizador genético ABI PRISM 3500XL de 24 capilares, adquirido en 2016 a través del proyecto FONDEQUIP EQM150077.

Nuestros servicios incluyen:

  • Secuenciación de ADN.
  • Análisis de fragmentos: microsatélites, MLPA, AFLPs, entre otros.
  • Preparación de muestras.

 


Secuenciación NGS

GridION(Oxford NanoporeTechnologies)

El secuenciador GridION de Oxford Nanopore Technologies es un equipo compacto de sobremesa que permite la secuenciación simultánea de hasta cinco celdas independientes. Gracias a su computadora incorporada, ofrece la capacidad de realizar el basecalling y el análisis en tiempo real de las lecturas obtenidas.

La tecnología de secuenciación Nanopore se destaca por la longitud ilimitada de sus lecturas, lo que permite la secuenciación de genomas completos, plásmidos, amplicones completos, y el análisis de variantes de splicing. Además, su algoritmo de basecalling permite la identificación de metilaciones, facilitando estudios epigenéticos.

Este equipo fue adquirido gracias a fondos FONDEQUIP.

MiSeq

El Illumina MiSeq es un poderoso equipo que permite la secuenciación de genomas pequeños y metagenómica. Con sus diversos kit es perfecto para múltiples aplicaciones en distintas escalas.

MiSeq

Contamos con acceso a los secuenciadores NextSeq500 y NextSeq1000 los cuales se caracterizan por su alto rendimiento y calidad. Perfectos para aplicaciones de RNAseq y genomas grandes.

iScan (Illumina)

El iScan es un potente lector de microarreglos de Illumina que permite la lectura de cientos de chips al día, manteniendo una alta calidad y reproducibilidad de los datos.

Sus aplicaciones son amplias, abarcando desde la genotipificación de SNPs y la detección de variaciones en el número de copias (CNV) hasta estudios de metilación. Existen cientos de chips diseñados por Illumina para diversas especies modelo, así como chips desarrollados por distintos consorcios científicos, disponibles para la comunidad.

Este equipo fue adquirido gracias a fondos FONDEQUIP.